Tarihimizin bize mîrası olan; ilmin neşet ettiği, ulemânın yetiştiği, bir medeniyetin inşasını sağlayacak olan pîrüpâk zihinlerin menbası olan külliyelerimiz bize ışık oldu. Bu ışığın bize gösterdiği yolda, geleneğimizden aldığımız kuvvetle Hacı Beşir Ağa Câmi’nde; genç dimağları, câmi mâneviyatını bizâtihi hissederken İslâmi ilimler tahsili görme imkanıyla kavuşturmaya niyet ettik.
Niyetimizin netîcesinde Beşir Ağa Külliyesi’nin ihtivâettiği âtıl durumdaki sıbyan mektebinin ihyâsıyla Beşirağa Akademi kuruldu. İlk inşa gayesine uygun olarak bu sıbyan mektebinde yeniden talebelerin hocalarının rahle-i tedrîsinden geçeceği bir ilim yuvasının tohumu atıldı.
Beşirağa Akademi’de, üniversitede okuyan öğrencilerin öğrenim sırasında kazandıkları meslekî donanımlara ziyâde olarak Müslüman şahsiyeti inşası esas alınır ve bu doğrultuda öğrencilere eğitim verilir. Eğitimin muhtevâsı; temel İslâmi ilimler (tefsir, kelâm, hadis…) ve bu ilimlerde Arapça metinleri okuyabilecek düzeyde nahiv üzerine yoğunlaşmış bir Arapça dersidir. Bu derslerin yanı sıra fikir dünyalarına katkı sağlaması, ufuklarını genişletmesi, hem kadim hem de çağdaş meseleler hakkında fikir sahibi olup bu konuları mukayese edip tartışabilecekleri bir ortamı sağlamak adına düzenli olarak söyleşiler, kitap tahlilleri ve seminerler tertip edilmektedir.
Beşirağa Akademi; İstanbul Üniversitesi İlâhiyat Fakültesi ile işbirliği protokol anlaşması bulunan, Fatih Müftülüğüne bağlı Hacı Beşir Ağa Câmi bünyesinde faaliyet gösteren iki yıllık bir eğitim programıdır. İki yılın sonunda Beşirağa Akademi’yi başarıyla tamamlayan öğrenciler İstanbul Üniversitesinden uluslararası geçerliliği olan başarı belgesini almaya hak kazanır.